新着情報
- 2016.09.05
2016年11月11日(金)に構造生命科学データクラウドVaProS第8回利用講習会「立体構造を用いた多型情報の解析」が東大農学部2号館で開催されます(詳細はこちら)。
- 2016.07.14
2016年9月1日(木)に構造生命科学データクラウドVaProS第7回利用講習会「VaProSを用いた立体構造モデリング入門」が愛媛大学プロテオサイエンスセンター 城北ステーションで開催されます(詳細はこちら)。
- 2016.07.14
2016年7月23日(土)にAll-in-one 合同講習会 2016 ~バイオビッグデータ解析入門~がVisLab OSAKA (グランフ ロント大阪 北館タワーC 9F)で開催されます(詳細はこちら)。
- 2016.05.09
2016年6月10日(金)に構造生命科学データクラウドVaProS第6回利用講習会「VaProSを用いたバイオビッグデータ解析入門」が九州大学馬出病院キャンパスで開催されます(詳細はこちら)。
- 2016.02.09
VaProS(構造生命科学データクラウド)のチュートリアルページに新たなチュートリアルが追加されました(チュートリアルページはこちら)。
- 2016.01.19
2016年3月15日(火)にH27年度 PDBj & 創薬等PF情報拠点VaProS第4回利用講習会「生命科学のための立体構造データ・ビッグデータの使い方入門」が大阪大学蛋白質研究所で開催されます(詳細はこちら)。
- 2015.12.13
VaProS(構造生命科学データクラウド)のマニュアルを公開しました(マニュアルはこちら)。
プロジェクトの概要
創薬等支援技術基盤プラットフォーム 情報拠点
構造生命科学データクラウドの構築運用と高度化
代表研究者:五條堀 孝
代表機関:情報・システム研究機構国立遺伝学研究所
構造生物学分野で実施された国家プロジェクトであるタンパク3000プロジェクトやターゲットタンパク研究プログラムの多彩な成果に加えて、新たなデータベースやツールも開発して、広範な生命科学分野における研究開発に十二分に活用できるように、使い勝手のよい情報基盤「構造生命科学データクラウド」として提供していくのが私たちの仕事です。
課題の概要
- これまで構築されたデータベースと利用ツールを継承・更新・運用し、さらに高度化して、創薬等支援技術基盤プラットフォームの解析拠点と制御拠点が必要とする情報の蓄積・提供と両拠点の成果普及を行うことによって、関連分野の研究を支援します。
- 構造生物学にゲノム情報・遺伝子発現情報・遺伝子ネットワーク等の他分野の生命情報を取り込みつつ、多種多様なデータベースを利用形態の差異を意識することなく活用できるようにします。
- 「構造生命科学データクラウド」を構築して、広範な生命科学の研究分野で構造生物学の先端研究成果を活用できる情報基盤を提供します。
構造生命科学データクラウド
構造生物学と他の生命科学分野の連携の基盤となる「構造生命科学データクラウド」(下の図を参照)は、大阪大学蛋白質研究所が分担する「構造生物学(タンパク質)統合データベース」を核に、タンパク3000プロジェクト、ターゲットタンパク研究プログラム、ゲノムネットワークプロジェクト、セルイノベーションプロジェクトなどの成果から精選した情報資源と、情報拠点の分担機関である東北大学、お茶の水女子大学ならびに東京大学が新たに創出する情報資源との融合によって、実現します。
「構造生命科学データクラウド」の概念図
情報拠点」はこの構造生命学データクラウドによって、わが国が今まで投資してきた関連分野のプロジェクトの成果を、構造生物学にとどまらず生命科学全体に浸透させ、関連する企業などの波及効果も考慮して、創薬等に向けた「発想を支援する俯瞰機能」と「問題解決を可能とする情報環境」を提供し、わが国における創薬等を支援する情報基盤の確立を目指します。
情報拠点の人々
代表機関
五條堀 孝 教授 |
国立遺伝学研究所 遺伝情報分析研究室 |