VaProS | FAQ

Q1 :	検索窓にキーワードを入力後、Enterキーを押しても検索が実行されないのはなぜですか？
A1 :	仕様によりその操作では検索できないようになっております。キーワードを入力後にSearchボタンを押すことで検索が実行可能となります。

Q2 :

キーワードによる検索後に検索結果の一覧表が表示されますが、詳細な情報をみるにはどのような操作をしたらよいのでしょうか？

A2 :

検索結果の一覧表は、3つのグループ別(Gene/Protein、Ligand、Phenotype)に表示されます。グループ別の一覧表の中身は、検索クエリに対するVaProS内外の複数のツールやデータベースの検索結果に基づいたヒット数やその詳細情報へのリンクです。興味のある項目に関してさらなる詳細情報を閲覧したい場合は、注目すべき項目の該当行の2列目のカラムのチェックボックスにチェックをいれます。次に、その一覧表のグループ名に対応するDetails (Go)ボタンを押します。この操作に関連する説明の詳細は、VaProSマニュアルの2. 検索結果のオーバービュー以降をご覧下さい。

Q3 :	検索結果の一覧表でMolecular InteractionsやPPIのヒット数が多いとネットワークがグラフで表示されないのはなぜですか？
A3 :	仕様によりMolecular Interactionsのヒット数が200未満の場合はネットワークで表示し、200以上の場合はテーブルで表示するようになっております。

Q4 :	特定のキーワードで検索するとMolecular Interactionsのネットワークでノードが表示されませんが、改善されますか？
A4 :	ウェブブラウザ固有の症状で、Safariではネットワーク表示用の外部ライブラリでエラーとなり正常に表示されない場合があります。他のウェブブラウザ(Chrome, Firefox)に変えていただくことで正常に表示されます。

Q5 :	Molecular Interactionsで、エッジの参照元DBのリンク切れ（またはリンクミス）で内容が表示されない場合があるのはどうしてでしょうか？
A5 :	VaProSは複数の外部データベースを参照しております。そのため、リンク元のサイトがメンテナンスなどで一時的にエラーを起している場合があります。しばらく経過した後に再度アクセスして下さい。

Q6 :	遺伝子名xxxで検索すると入力候補に表示されたxxx1やxxx2などの連番の遺伝子名が検索結果に出てきません。連番の遺伝子名を検索結果に出すにはどうしたらよいでしょうか？
A6 :	キーワード検索上の仕様で、xxx [gene/protein]と入力し検索していただくことで可能となります。または、UniProt AC番号かEntrezGene IDがわかれば ID List検索を利用することで同時検索が可能です。

Q7 :	キーワードによる検索後にあらわれる検索結果の一覧表で、タンパク質や遺伝子の名前が切れている場合があります。そのため、詳細表示をしたい分子が選別できません。名前全体を知るにはどうすればよいですか？
A7 :	検索キーワードの属性が、gene、protein、あるいはgene/proteinの場合はEntrezGene IDやUniProtKBカラムのリンク先、Ligandの場合はReference DBカラムのリンク先の情報で確認して下さい。

Q8 :	キーワードによる検索後にあらわれる検索結果の一覧表で、ある特定のデータベースに関連情報が多い分子を捜したいのですが、どうすればよいですか？
A8 :	各カラムでソートできます。カラム名称の横にある上三角／下三角マークをクリックしてください。